在午觉睡醒后头疼通常有如下几个因素：

1、午睡时的睡眠时间相对较短，人很难进入深睡眠时相，在午睡阶段都是浅睡眠时相，浅睡眠时相时神经系统不能完全做到充分的放松，这时睡醒后就会出现一定的神经性头疼的情况发生。

2、在睡午觉的时候，如果出现颈椎病、肩周不适应或出现了一定的颈肩压迫，这时也会在睡午觉之后醒来，觉得有一定的神经血管源性的头疼。

3、人在睡午觉的时候，如果在睡眠过程中受到了声、光、电的刺激。因为午后时自然的规律是外界有阳光，这时如果在睡觉时收到了光的刺激时，也会出现短暂性的神经元异常放电，睡醒时也会出现头疼。